مدیر حوزه‌های علمیه کشور با صدور پیامی با تسلیت درگذشت آیت‌الله گیلانی فرمودند: ایشان در طول سالیان عمر پر برکتش به تعلیم و نشر علوم اسلامی و معارف اهل بیت(ع) پرداخته است.
در پیام تسلیت حضرت آیت‌الله سید هاشم حسینی بوشهری«دامت برکاته» آمده است: خبر ارتحال فقیه، مجاهد، عالم ربانی حضرت آیت‌الله حاج شیخ محمدمحمدی گیلانی(ره) یار دیرین حضرت امام(ره) و رهبر معظم انقلاب اسلامی موجب تاثر و تاسف شد.
در ادامه این پیام آمده است: او که سال‌ها در محضر امام(ره) تلمذ کرده و از دانش آموختگان برجسته جلسات درسی فقهای نامدار حوزه همچون آیت‌الله العظمی بروجردی(ره) و علامه طباطبایی به شمار می‌رفت در طول سالیان عمر پر برکتش به تعلیم و نشر علوم اسلامی و معارف اهل بیت(ع) پرداخته و خدمات شایان توجه او در سنگر شورای نگهبان، مجلس شورای اسلامی، نمایندگی حضرت امام(ره) در دانشگاه‌ها، دیوان عالی کشور، شورای بازنگری قانون اساسی و مجمع تشخیص مصلحت نظام نقطه عطف حیات طیبه او به شمار می‌رود.
در بخش پایانی این پیام تصریح شده است: اینجانب ضمن عرض تسلیت درگذشت آن بزرگوار به ساحت مقدس حضرت بقیه الله الاعظم، رهبر معظم انقلاب اسلامی، مراجع عظام تقلید، حوزه های علمیه و بیت مکرم ایشان علو درجات آن مرحوم را از خداوند غفار مسئلت دارم.