حضرت آیت‌الله مظاهری در دیدار دبیر شورای عالی حوزه های علمیه کشور، با اظهار مسرّت از انتخاب آیت الله حسینی بوشهری به عنوان دبیر شورای عالی، گفتند: رسالت و مسئولیّت شورای عالی و دستگاه‌های اداره‌کنندۀ حوزه‌های علمیّه بسیار خطیر است.
ایشان در پایان بیانات خود با اشاره به سوابق برجستۀ آیت‌الله حسینی بوشهری در خدمت به حوزه‌های علمیّه، برای توفیقات ایشان در مسئولیّت جدید دعا کردند.
آیت‌الله حسینی بوشهری نیز در این دیدار با بیان اینکه حوزه علمیه اصفهان پس از مهاجرت آیت‌الله العظمی مظاهری، با حرکتی پرشتاب، در حال پیمودن مسیر رشد و ارتقاء در ابعاد مختلف است، از حمایت‌ها و پشتیبانی‌های معظّم‌له از حوزه‌های علمیّه و نهادهای حوزوی و نیز از الطاف و مراحم همیشگی ایشان تشکّر و قدردانی کردند.
دبیر شورای عالی حوزه های علمیه کشور با تأکید بر ضرورت استمرار همکاری و هماهنگی حوزه‌های علمیه قم و اصفهان به عنوان دو حوزۀ بزرگ جهان تشیّع، تقویت و رشد این همکاری‌ها را بسیار لازم و مطلوب ارزیابی کردند.